Ученые установили новые особенности метилирования ДНК

Печать E-mail
Рейтинг пользователей: / 1
ХудшийЛучший 
Актуальные темы - Стволовые клетки
Автор: Administrator   
14.06.2010 15:18

 

Ранее неизвестный паттерн метилирования ДНК – процесса, влияющего на функции клеток путем изменения экспрессии генов – открыт учеными, изучающими стволовые клетки в Калифорнийском университете в Лос-Анджелесе (University of California - Los Angeles, UCLA). Это открытие может иметь значение для предупреждения некоторых форм рака и исправления дефектов в линиях человеческих стволовых клеток.


Профессор Стивен Джекобсен (Steven E. Jacobsen)

 

Профессор Стивен Джекобсен (Steven E. Jacobsen).

(Фото: newsroom.ucla.edu)

 

 

 

Группа ученых установила взаимосвязь между метилированием ДНК и положением нуклеосом, регулирующих доступ к ДНК в ядре клетки и делающих ее более компактной. Открытие было сделано с помощью высокопроизводительного секвенирования ДНК, проводившегося с целью изучения сайтов ДНК с высоким уровнем метилирования, Маттео Пеллегрини (Matteo Pellegrini) и Стивом Джекобсеном (Steve Jacobsen) из Центра исследования стволовых клеток Бродов (Broad Stem Cell Research Center) при UCLA.

Работа опубликована в журнале Nature.

Необходимые для выживания клетки процессы зависят от ее способности хранить и читать генетическую информацию, закодированную в ее ДНК. Упаковка длинной молекулы ДНК в крошечное ядро осложняется тем, что ДНК должна оставаться доступной для клеточных молекулярных механизмов. Молекулы, упаковывающие ДНК, называются нуклеосомными ядерными частицами. На каждую из них накручивается около 147 пар оснований ДНК. Такое взаимодействие формирует своего рода платформу для уплотнения длинного полимера ДНК, одновременно сохраняя его доступность для метилирования.

«Метилирование ДНК важно для регуляции генов и играет значительную роль в дифференцировании эмбриональных стволовых клеток и развитии некоторых форм рака», - говорит научный сотрудник Медицинского института Говарда Хьюза (Howard Hughes Medical Institute) профессор молекулярной, клеточной и эволюционной биологии Джекобсен. «Изменения в метилировании ДНК ответственны за многое из того, что делает стволовую клетку стволовой, так как в процессе дифференциации клетки метилирование ДНК проявляет тенденцию к изменению. Одним из аспектов понимания метилирования является понимание его паттернов и того, как оно протекает в клетке», - говорит Джекобсен.

В этой работе ученые из UCLA установили, что накрученная на нуклеосомы ДНК метилирована в большей степени, чем ДНК, связывающая соседние ДНК-нуклеосомные комплексы.

«Наши результаты показывают, что положение нуклеосом оказывает влияние на паттерны метилирования ДНК в пределах всего генома и что ДНК-метилтрансферазы (ферменты, метилирующие ДНК) преимущественно взаимодействуют с ДНК, связанной с нуклеосомами», - говорит доцент молекулярной, клеточной и эволюционной биологии Пеллегрини.

Цветок Арабидопсиса Таля (Arabidopsis thaliana)

 

Цветок Арабидопсиса Таля (Arabidopsis thaliana).

(USDA-Agriculture Research Service photo by P. Greb)

 

 

 

Первоначально работа была проведена на Arabidopsis, сорняке, широко используемом для генетических исследований растении. Затем Пеллегрини и Джекобсен повторили работу на стволовых клетках человека, где обнаружили аналогичную зависимость.

Одним из наиболее важных и неизвестных аспектов ДНК-метилирования является то, как клетка определяет, где именно должно происходить метилирование, и паттерн положения нуклеосом становится важным фактором, определяющим этот процесс.

Это открытие может иметь значение для борьбы с раком, так как паттерны метилирование ДНК при раке искажены, что часто приводит к инактивации генов-супрессоров опухолей. Чем больше ученые будут знать о клеточных механизмах, устанавливающих правильные паттерны метилирования ДНК, тем лучше они смогут управлять этим процессом. В будущем такого рода исследования смогут привести к разработке методов, позволяющих контролировать искаженные паттерны метилирования, ведущие к раку, и предотвращать, таким образом, его развитие.

А так как метилирование ДНК имеет большое значение и для дифференциации стволовых клеток, эти знания могут привести к возможности исправлять дефекты линий стволовых клеток.

 

 

По материалам

Study finds new pattern in DNA methylation, with implications for cancer, stem cell lines

 

Оригинальная статья:

Ramakrishna K. Chodavarapu, Suhua Feng, Yana V. Bernatavichute, Pao-Yang Chen, Hume Stroud, Yanchun Yu, Jonathan A. Hetzel, Frank Kuo, Jin Kim, Shawn J. Cokus, David Casero, Maria Bernal, Peter Huijser, Amander T. Clark, Ute Krämer, Sabeeha S. Merchant, Xiaoyu Zhang, Steven E. Jacobsen, Matteo Pellegrini. Relationship between nucleosome positioning and DNA methylation

 

© «Ученые установили новые особенности метилирования ДНК». Полная или частичная перепечатка материала разрешается при обязательной незакрытой от индексации, незапрещенной для следования робота активной гиперссылке на страницу Стволовые клетки. Письменное разрешение обязательно.

 

Еще о работе профессора Джекобсена


Составлена карта распределения «шестого основания» ДНК – 5-гидроксиметилцитозина – в человеческих эмбриональных стволовых клетках

 

и о стволовых клетках


Роль коротких РНК в репрессии генов в стволовых клетках

Белок Tet1 возвращает стволовым клеткам свойство плюрипотентности

Ученые предлагают безопасный способ перепрограммирования клеток с помощью РНК

Дифференциация стволовых клеток определяется не только химическими факторами

Биологи открыли микроРНК, регулирующие функции стволовых клеток крови

Больным раком могут помочь микроРНК, увеличивающие число стволовых клеток крови

Ученые восстановили сердечную мышцу мышей методом прямого перепрограммирования клеток

Разработаны более совершенные поверхности для выращивания стволовых клеток

Впервые выделенные взрослые стволовые клетки молочной железы мышей помогут изучению рака груди

Ученые установили теснейшую связь между онкогеном Myc и сохранением стволовыми клетками свойства плюрипотентности

 

 

 

Related Articles:
 
 

Vinaora Visitors Counter

mod_vvisit_countermod_vvisit_countermod_vvisit_countermod_vvisit_countermod_vvisit_countermod_vvisit_countermod_vvisit_counter
mod_vvisit_counterToday15
mod_vvisit_counterYesterday0
mod_vvisit_counterThis week15
mod_vvisit_counterLast week0
mod_vvisit_counterThis month15
mod_vvisit_counterLast month0
mod_vvisit_counterAll days4459442

We have: 12 guests, 3 bots online
Your IP: 3.87.133.69
 , 
Today: Мар 28, 2024

Подписаться на рассылку

Лучшие обменники

Обменники электронных валют