logo

Пользовательского поиска

Monday 23rd of July 2018

Длинная некодирующая РНК, регулирующая пре-мРНК-сплайсинг, ассоциирована с раком

Печать E-mail
Рейтинг пользователей: / 0
ХудшийЛучший 
Актуальные темы - Вести из лабораторий
Автор: Administrator   
25.09.2010 21:44

2

Профессор кафедры биологии клетки и биологии развития Каннанганатту Прасант (Kannanganattu Prasanth) (слева), постдокторант Видиша Трипати (Vidisha Tripathi) (сидит), научный сотрудник Дэвид Сонг (David Song) и их коллеги установили, что длинная некодирующая РНК, MALAT1, играет ключевую роль в пре-мРНК-процессинге. Аберрантная регуляция гена MALAT1 связана с несколькими видами рака, как и несколько факторов сплайсинга, которые он регулирует. Также, некоторые гены, сплайсинг пре-мРНК которых регулируется MALAT1 – гены с «раковой подписью». (Photo by L. Brian Stauffer)

 

Длинная некодирующая РНК MALAT1, вовлеченная в развитие некоторых форм рака, регулирует пре-мРНК-сплайсинг – важный этап самой ранней стадии синтеза белка. Исследование, подтверждающее этот факт, опубликовано в журнале Molecular Cell.

 

Около 5 процентов генома человека кодируют белки, и ученые только начинают понимать роль остального, «некодирующего», генома. Одни из последних недавно исследованных некодирующих генов – транскрибируемых с ДНК на РНК, но обычно не транслируемых в белки – длинные некодирующие РНК (long non-coding RNAs - lncRNAs).

До полного секвенирования генома человека, «мы жили в белок-центрическом мире», говорит профессор кафедры биологии клетки и биологии развития Иллинойского университета (University of Illinois) Каннанганатту Прасант (Kannanganattu Prasanth), руководивший исследованием. Однако с секвенированием генома стало ясно, что большинство генов кодируют РНК, не транслируемые в белки.

В последние годы исследования некодирующих РНК активно развиваются, но большинство работ сосредоточено только на малых некодирующих РНК, которые играют важную роль в нескольких аспектах жизнедеятельности клетки. Длинные некодирующие РНК изучаются сравнительно мало. Как результат, ученые только начинают понимать функции некоторых lncRNAs.

Лаборатория Прасанта сосредоточила свое внимание на роли длинных некодирующих РНК, таких как MALAT1, обычно находящихся в ядре клеток млекопитающих.

Предварительные исследования предполагают, что lncRNAs выполняют в клетках жизненно важные регуляторные функции. Нарушение этих функций, говорит Прасант, приводит к серьезным последствиям. Аномальная экспрессия гена MALAT1, например, прослеживается при многих формах рака, включая рак груди, легких и печени, «поэтому научный мир заинтересован в том, чтобы узнать, что эти РНК делают в нормальных клетках и какие изменения в их экспрессии коррелируют с раком», говорит профессор.

Прасант является первым соавтором еще одной работы, недавно опубликованной в журнале The EMBO Journal, в которой было установлено, что MALAT1 играет определенную роль в доставке важных белков, называемых факторами пре-мРНК-сплайсинга, к сайту транскрипции гена в ядре.

Сплайсинг пре-мРНК предполагает вырезание ненужных последовательностей и «склеивание» матричных РНК до того, как они экспортируются из ядра и транслируются в белки.

«Это исследование дало нам подсказку о том, что MALAT1 – важный ген, который может принимать участие в метаболизме мРНК», - говорит Прасант.

В новом исследовании он и его коллеги проверили гипотезу о том, что MALAT1 взаимодействует и модулирует поведение группы факторов пре-мРНК-сплайсинга, известной как SR-семейство факторов сплайсинга.

Исследователи установили, что последовательность MALAT1 содержит несколько областей, которые могут связывать белки SR-сплайсинга. Дальнейшие исследования показали, что MALAT1 действительно связывается с несколькими членами семейства SR-белков, проанализированными учеными.

Более того, гипоэкспрессия MALAT1 или гиперэкспрессия факторов сплайсинга, с которыми MALAT1 может связываться, приводит к одним и тем же изменениям в сплайсинге большого количества пре-мРНК в клетках, что свидетельствует о том, что MALAT1 взаимодействует с факторами сплайсинга и регулирует их доступ к новым транскриптам.

«Все данные свидетельствуют о том, что MALAT1 функционирует как регулятор сплайсинга путем модулирования уровней факторов сплайсинга в клетке. Эта работа подтверждает, что MALAT1 играет ключевую роль в процессинге пре-мРНК с большими последствиями для здоровья человека», - говорит Прасант. «Многочисленные исследования показали, что аберрантный сплайсинг пре-мРНК – основной вопрос, связанный с возникновением нескольких заболеваний, включая рак. Некоторые из факторов, о которых известно, что они взаимодействуют с MALAT1, являются онкогенами. Если усилить экспрессию этих генов, можно превратить клетку в раковую. Также, некоторые гены, сплайсинг пре-мРНК которых регулируется MALAT1, являются генами с «раковыми подписями». Это значит, что их аномальная экспрессия непосредственно коррелирует с несколькими видами рака».

 

 

По материалам

Cancer-associated long non-coding RNA regulates pre-mRNA splicing

 

Аннотация к статье: Vidisha Tripathi, Jonathan D. Ellis, Zhen Shen, David Y. Song, Qun Pan, Andrew T. Watt, Susan M. Freier, C. Frank Bennett, Alok Sharma, Paula A. Bubulya, Benjamin J. Blencowe, Supriya G. Prasanth, Kannanganattu V. Prasanth. The Nuclear-Retained Noncoding RNA MALAT1 Regulates Alternative Splicing by Modulating SR Splicing Factor Phosphorylation

 

 

Related Articles:
 

Vinaora Visitors Counter

mod_vvisit_countermod_vvisit_countermod_vvisit_countermod_vvisit_countermod_vvisit_countermod_vvisit_countermod_vvisit_counter
mod_vvisit_counterToday639
mod_vvisit_counterYesterday1590
mod_vvisit_counterThis week2229
mod_vvisit_counterLast week7705
mod_vvisit_counterThis month22345
mod_vvisit_counterLast month29238
mod_vvisit_counterAll days4056791

We have: 26 guests online
Your IP: 54.158.248.112
 , 
Today: Июл 23, 2018

RSS

Новое на LST

Работает на Joomla!. Valid XHTML and CSS.